近年來中西醫結合治療消化系統疾病已取得了卓越的臨床療效，在某些疑難病方面亦顯露出更大的優勢和苗頭。現擇其著者，以示其概：
胃病方面，中西醫結合在治療慢性萎縮性胃炎及胃癌前病變中，臨床證候改善較西藥快速而顯著，胃黏膜的急性炎症性病變消退明顯，對胃黏膜萎縮、腸上皮化生及異型增生也顯示出一定的緩解和逆轉作用。中藥對消化性潰瘍的治療效果明顯，並能減少復發。中西藥結合抗Hp的三聯療法不僅其根除率可達到90%以上，而且具有副作用少、費用低、療效穩定和依從性好的優點。腸病方面，中藥的全身辨證用藥加局部灌腸給藥或中西藥結合療法對慢性非特異性潰瘍性結腸炎的療效優於或相似於西藥，其療效穩定、副作用少，具有更大的優越性。中藥對改善胃腸道各部位的動力紊亂均具有很強的調理作用，尤其中藥的雙向調節作用，更為其他西藥所莫能及，具有很大的潛在價值，值得深入發掘。
中西醫治療病毒性肝炎在改善臨床症候和肝功能損害上，療效較西藥明顯，在增強*自身免疫力和調節營養代謝失調方面也不遜色，尤其是防治肝纖維化和肝硬化，更顯示出卓著的效果，非西藥所能及。
此外，膽胰疾病方面，中西藥結合治療急性膽囊炎和膽石症有良好的效果，雖炎症消退與西藥相差無幾，但症狀好轉快，療效鞏固。對急性水腫性胰腺炎僅用中藥就能治愈，中西藥結合治療急性重型胰腺炎，可明顯提高療效，減少合並症，降低死亡率。實驗研究證明，通裡攻下法和活血化瘀法對重型胰腺炎並發的肺損傷、胰腺血循障礙，腸屏障破壞都有很好的保護和改善作用，為療效提供了細胞分子學的理論依據。在以上這些消化系統疾病的治療中，中西醫結合取得的療效為發展新的學術思想打下了良好的基礎，因為有了好的療效，並能闡明其療效機制，其中就必然存在某種值得探索的科學理論依據。
中西醫結合防治消化系統疾病雖然取得了不少的進展，但距離創建中西醫結合新消化病學的要求仍然相差很遠。所以，我們認為今後要搞好中西醫結合工作，首先要抓住重點，認准突破口，狠下功夫，才能取得更大的成績。首先，要在“疑難病”治療中發揮中西醫結合的優勢，例如中醫或中西醫結合治療慢性萎縮性胃炎雖有一定療效，但其確切效果仍需進一步擴大驗證，其重點應放在癌前病變防治上。消化性潰瘍病的近期愈合，中西醫療效大致相似，但復發率很高。因此，提高和鞏固療效，防止復發是中西醫結合治療消化性潰瘍病的發展方向。加強對胃腸道癌前病變、出血性壞死性腸炎和偽膜性腸炎等疑難疾病的防治和研究。
目前認為慢性非感染性、尤其是胃腸道功能性疾病，大多數病因及發病機理尚未徹底闡明，但這類疾病臨床上發病率很高，症狀繁多，反復遷延，常給病人帶來痛苦，一般西藥治療效果並不滿意。而中醫和中西醫結合治療可通過辨證論治，也就是結合患者的社會心理、體質、生物和環境等諸多影響因素，加強“針對性”、“個體化”和“綜合性”治療，常能取得突出效果，這正反映了中醫辨證論治的優勢和特色，是很值得進一步深入研究的課題。
